Datenbankgestützte Online Sequenzierung

Intelligente datenabhängige Massenspektrometrie (LTQ-TF)

Das Szenario: In der Proteomforschung fallen Massenspektren von Peptidgemischen in rascher Taktfolge an. Die Kopplung eines Trennsystems (HPLC) mit dem Massenspektrometer (MS) führt zu Zeitfenstern, in denen die verschiedenen Protein- und Peptidspezies gemessen werden können. Dabei können teilweise sehr unterschiedliche Konzentrationen von gleichzeitig detektierbaren, aber unterschiedlichen Spezies auftreten.

Es ist daher sinnvoll und wünschenswert, das Massenspektrometer nicht nach einer starren und vorgegebenen Prozesssteuerung arbeiten zu lassen, sondern intelligent und datenabhängig in die Messungen einzugreifen.

Link: Projekt Trac Massenspektrometrie (intern)

Die entstehende Software wird den Namen DBnovo Sequencing tragen.